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转录组测序是研究基因表达调控的主要手段。二代高通量测序(NGS)技术通量高,但测序读长短,产生的拼接错误往往造成转录本结构鉴定不完整,准确鉴定转录本结构,是深入研究基 ...
2021-12-14T2T(Telomere-to-Telomere)基因组是通过多种测序平台、高深度测序,组装获得的gap-free或近gap-free高质量基因组。该技术解决了着丝粒或高重复区域的组装难题,使得染色体的连续性和完整 ...
2021-12-14拷贝数变异(Copy Number Alteration,CNAs)是遗传变异的重要来源之一。目前,在癌症中,CNAs主要通过短读长测序数据分析获得。与短读长测序技术相比,新兴的纳米孔测序技术(Nanopore ...
2021-12-13青藏高原居民适应平均海拔4000米以上的青藏高原,是现代人类征服新环境条件的典型案例。前人利用SNV寻找藏族高原适应的证据,成功鉴定到两个与缺氧诱导转录因子途径相关的基因 ...
2021-12-03青藏高原居民适应平均海拔4000米以上的青藏高原,是现代人类征服新环境条件的典型案例。前人利用SNV寻找藏族高原适应的证据,成功鉴定到两个与缺氧诱导转录因子途径相关的基因 ...
2021-11-17棉-瓜蚜虫是一种分布于世界各国的常见害虫。该研究分别选取了棉花偏好性的单倍型Hap1和葫芦科偏好性的Hap3蚜虫,使用三代测序和Hi-C技术,构建了两个蚜虫高质量染色体水平基因组。 ...
2021-11-08草莓属(Fragaria spp.)包含约25个种,具有不同的繁殖系统及多种自然倍性变异。 该研究报道了5个二倍体野生草莓的染色体水平基因组,构建了草莓的泛基因组及核心基因集,重建了重 ...
2021-11-08人工诱导的三倍体虹鳟鱼具有不育性状,为研究减数分裂机制和倍性操控模式提供了优异的研究对象。本研究在虹鳟全雌三倍体规模化制种的基础上,开展了不同发育时期全雌二倍体和 ...
2021-11-03肠道微生物群失调与许多健康不良情况有关,包括糖尿病、哮喘、过敏、肥胖和自闭症等,而饮食对肠道内的微生物组成有主要影响。 地中海饮食(MD)是一种以自然的营养物质为基础 ...
2021-10-09点击蓝字关注我们 宏基因组组装基因组(MAG)方法是揭示未培养微生物的代谢和功能潜力的有效方法。而通过二代宏基因组组装和分箱的MAG通常是高度碎片化,具有异质序列污染。本研究 ...
2021-10-08